يعد مكتب الأيتام مسؤولاً من كل شؤون الأيتام بالمنظمة (الكفالة الشهرية، الدعم العيني، الإسناد الاكاديمي، إعداد الملفات الصحية لأسر الأيتام، الإشراف على أمانات الأيتام اللامركزية في المجمعات)، ويعد حلقة الوصل في كل شيء له علاقة بالأيتام، و يعمل على مخاطبة المجتمع من خلال البرامج و المشاريع الخاصة به .