يعد مكتب الطبية مسؤولاً عن كل الانشطة الطبية (عمل ملفات صحية لكل الأيتام المكفولين من قبل المنظمة، متابعة الحالات الصحية الخاصة بأسر الأيتام والمحتاجين، الحملات التوعوية، الإشراف على أمانات الطبية اللامركزية في المجمعات)، كما أن من مهامها الإشراف على المشروعات والأنشطة الطبية التي تقام على مستوى المنظمة.